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tak0kadaの医学メモ

発声練習、生存確認用。

数理統計関連は 何でもノート

「バイオインフォマティクス入門」を読んだ

バイオインフォマティクス 読書メモ

随分前からちまちま読み進めていた慶應義塾大学出版会 | バイオインフォマティクス入門 | 日本バイオインフォマティクス学会を読み終わった。記憶にない部分ももう多いのだが。。80項目について2ページずつ解説する総論的な本で、特に詳細はまでは立ち入らず分野の全体像を理解するのに良いと思った。

目次

  • 第1章: 生命科学
  • 第2章: 計算科学
  • 第3章: 配列解析
  • 第4章: 構造解析
  • 第5章: 遺伝、進化解析
  • 第6章: オーミクス解析

第1章: 生命科学

  • 原核細胞と真核細胞
  • 細胞内小器官
  • 細胞周期
  • DNAの複製
  • 転写
  • 翻訳
  • 核酸の構造と機能
  • アミノ酸の構造と性質
  • タンパク質の階層構造
  • 生体膜と膜タンパク質
  • 翻訳後修飾
  • 免疫と代謝
  • シグナル伝達
  • 遺伝
  • ゲノムと生物
  • ヒトゲノム
  • 遺伝子組み換え
  • ゲノム解析
  • 分子生物学実験技術
  • タンパク質の立体構造決定

第2章: 計算科学

第3章: 配列解析

  • 分子生物学データベース
  • 配列アラインメント
  • スコア行列
  • 高速な類似配列検索
  • ホモロジー検索
  • マルチプルアラインメント
  • モチーフ
  • ゲノムプロジェクトと遺伝子予測
  • タンパク質の機能予測
  • RNAの二次構造予測
  • ゲノム特徴抽出
  • ゲノム比較

第4章: 構造解析

  • 構造化学
  • タンパク質の立体構造
  • 構造モチーフ
  • 構造分類
  • その他の生体分子の立体構造
  • 立体構造データベース
  • 立体構造の比較
  • タンパク質立体構造の保存性分析
  • 相互作用分析
  • マップ分析
  • 立体構造予測
  • 分子動力学計算

第5章: 遺伝、進化解析

  • ハーディー・ワインベルグ平衡
  • 連鎖解析
  • 遺伝子マーカー
  • ゲノムワイド関連解析
  • 分子進化
  • 進化系統樹
  • パラログ・オーソルグ
  • 系統推定アルゴリズム

第6章: オーミクス解析

  • オーミクス解析の研究手法
  • 次世代シークエンサー
  • DNAマイクロアレイ
  • タンパク質間相互作用
  • 遺伝子発現クラスタリング
  • 微分方程式
  • システム安定性
  • ネットワークの構造と性質