tak0kadaの医学メモ

発声練習、生存確認用。

数理統計関連は 何でもノート

ゲノム

fix patch, novel patch

patchという概念があるらしい。http://genome.ucsc.edu/blog/patches/ を眺めている。 GRC(genome reference consortium)という団体がゲノムのリファレンスの管理をしている GRCh38/hg38が一番新しいリファレンス 単なる塩基配列ではなくて意味付け(アノテー…

モチーフaがある要素(TSS-logic or DE-logic)にenrichされている確率、とは

The cis-Regulatory Atlas of the Mouse Immune System - ScienceDirectより。 ここで言うモチーフaはある転写因子Aが結合する、特定のDNA配列を指す配列のこと。補足資料から例を上げるとENSMUSG00000018678_LINE317_Sp2_Iという名前のモチーフにはSp2とい…