de Finetti diagram (wikipedia)という遺伝子型の頻度を表す絵がある。対立遺伝子AとBがあるとき、この絵では点AA、点AB、点BBを正三角形の頂点になるように配置した、2次元単体になっている。 ここで、ハーディー・ワインベルグ平衡が成立する場合について…

以下のような書き込みをはるか昔に見たことがあり、講義でdiversityについて扱う気配があったのでメモ。Shannon diversity (wikipedia)という量があって、標本内の多様性を表現できるらしい(詳細は全く確認していない)。個別の要素の回帰が難しくても(個人に…

patchという概念があるらしい。http://genome.ucsc.edu/blog/patches/ を眺めている。 GRC(genome reference consortium)という団体がゲノムのリファレンスの管理をしている GRCh38/hg38が一番新しいリファレンス 単なる塩基配列ではなくて意味付け(アノテー…

The cis-Regulatory Atlas of the Mouse Immune System - ScienceDirectより。 ここで言うモチーフaはある転写因子Aが結合する、特定のDNA配列を指す配列のこと。補足資料から例を上げるとENSMUSG00000018678_LINE317_Sp2_Iという名前のモチーフにはSp2とい…

病理ローテ中にICPの診断を付けた標本があり、確か外科病理学を参照して診断名を書いたような気がする。とりあえず、MPS$\supset$ICPだという認識。(参考: https://www.jstage.jst.go.jp/article/jjsa/74/8/74_2245/_pdf) 炎症性疾患はWHO分類にはほとんど記…

Ahmet et al. Bone marrow histopathology in peripheral T-cell lymphomas 骨髄転移だけでPTCLの診断をする羽目になった時に便利そう https://ja.wikipedia.org/wiki/ΓδT細胞 αβT細胞はCDマーカーで細かく記事が分かれている Gaulard et al. Expression of …

唾液腺上皮性腫瘍の「Canalicular adenoma」の訳語を調べていたところ、weblioとeijiroで「管状腺癌」という誤訳を発見した。adenomaなので腺腫だろうと思っていたが、流石に目を疑って調べ直したところ、WHO分類でBenign epithelial tumoursに分類されてい…